Nuestra iniciativa Reclone fue destacada en una nota-entrevista en la revista Science. El alto costo de los reactivos biológicos, sumado a la logística de importación en cadena de frío y las demoras asociadas a la burocracia de importación dificultan el acceso a la biotecnología en países de latinoamérica. Este modelo centralizado de producción de reactivos no solo es propenso a fallas en situaciones de alta demanda (e.g. pandemia) sino que también acelera la asimetría de desarrollo CyT entre países. Frente a estas barreras, Reclone ha desarrollado una red distribuida global que comparte una colección de módulos genéticos de libre acceso y protocolos abiertos a partir de los cuales se pueden producir enzimas libres de patente a bajo costo. Esas enzimas se usan en una gran variedad de aplicaciones y en particular en diagnóstico molecular, investigación y docencia.
link a nota: https://tinyurl.com/reactivos
Este trabajo ha sido desarrollado junto a muchos colaboradores/as (Ginkgo, Free Genes, PB3 lab, etc) pero principalmente junto a nuestra amiga Jenny Molloy (co-fundadora y coordinadora global de reclone) y con el trabajo Isaac Nuñez, Tamara Matute y Anibal Arce de nuestro lab durante la pandemia. Continuado por el trabajo de Severine Cazaux, Valentina Ferrando, Javiera Aviles, Ariel Cerda, Alejandro Aravena, Daniel Nuñez, Tomas Oliva, y muchos más, quienes están capacitando a muchas personas en el acceso a estos recursos. Más detalles en: reclone.org
Con financiamiento de Chan Zuckerberg Initiative y CYTED estaremos trabajando por 4 años en la expansión de esta red en Latinoamérica. Aguante el libre acceso a la tecnología (y aguante boquita).
Foto: Severine Cazaux en uno de nuestros cursos de capacitación Reclone desarrollados en la @universidadaustraldechile , Valdivia, junto a Gudrun Kausel).
Un hito importante hacia la creación de una red latinoamericana que trabaje en cooperación en la creación de reactivos de libre acceso (dominio publico) para investigacion, docencia e investigación.
A partir de un acuerdo generado con la Red ReClone, se desarrollará una plataforma institucional en la Universidad para la implementación de un repositorio sostenible de enzimas de acceso libre.
“Es un placer anunciar este tipo de iniciativas, buscamos como Universidad la unión con una propuesta global para que la ciencia sea más accesible y colaborativa” afirmó Teresa Damiani (UNC Mendoza). Además, en referencia a la relevancia del acuerdo, la secretaria de Investigación, Internacionales y Posgrado explicó que estas acciones “construyen redes globales, en las que nuestra universidad es parte, fortalecer el conocimiento es desarrollar este tipo de propuestas, que buscan superar desigualdades permitiendo mayor participación y democratización”, concluyó.
Registro de lo que fue la presentación del proyecto Comunicaciones Especulativas (@interspecifics ) en Cineteca Nacional del Centro Cultural La Moneda. Este proyecto nació como una colaboración entre el colectivo Interspecifics (México), el KeymerLab (Shenzhen/Aysen) y nuestro grupo de investigación. (mix de fotos nuestras y de https://www.instagram.com/hi_sashi/)
Comunicaciones Especulativas es una composición audiovisual elaborada por @interspecifics a partir de patrones y comportamientos colectivos en bacterias, extraídos con técnicas de computer vision y machine learning desde observaciones microscópicas con dispositivos de open source hardware. Todos los códigos y archivos de diseño/control de microscopios están en la página de interspecifics y en nuestros repositorios (e.g. github).
Actividad organizada por la Cineteca Nacional de Chile y Museo de Arte Contemporáneo, en el marco del proyecto FONDECYT Regular 1211218, con el auspicio de CYTED (@regosh_libre ), FONDECYT e Iniciativa Milenio (@ibiochile ).
Gracias Felipe, Leslie, Emmanuel y Paloma, siempre es lindo trabajar con uds 🙌❤️
Junto al Museo de Arte Contemporáneo (@anilla_mac ) y al Colectivo @interspecifics , hemos desarrollado talleres de capacitación en microscopía con open source hardware, biofísica de patrones biológicos, y técnicas de composición audiovisual como interfaces biotecnológicas para la creación de piezas audiovisuales. En este taller, se han utilizado técnicas de biología para el cultivo de bacterias del suelo, técnicas de computer vision y machine learning para analizar patrones y convertirlos en composiciones utilizando diversas herramientas como puredata, python, entre otras.
El taller estuvo dirigido a artistas, musicxs, diseñadorxs, cientificxs y entusiastas. Los ejercicios resultantes se presentarán el día de mañana (Miércoles 5 de Abril) en el Museo de Arte Contemporáneo del Parque Forestal.
Actividad financiada por proyectos CYTED, FONDECYT Regular 1211218 y el Instituto Milenio iBio.
¿Por qué un taller en tecnologías libres y abiertas para la docencia en ciencias?
En los últimos años, las tecnologías libres y en particular las herramientas científicas abiertas han ganado visibilidad entre investigadores y laboratorios de todo el mundo. Desde la fabricación de respiradores durante la pandemia hasta la construcción de equipos para analizar la densidad nutricional de alimentos, las tecnologías libres demuestran su potencial para dar respuesta a problemas complejos desde la apertura de la ciencia a nuevos actores y grupos sociales.
En nuestro contexto las tecnologías libres cobran todavía mayor relevancia. Frente a las históricas deficiencias de tecnología en las universidades y los reducidos presupuestos para ciencia, estas tecnologías constituyen una oportunidad concreta de acceso a infraestructura para la producción de conocimiento y abordaje de problemas relevantes. Contar con herramientas accesibles y modificables abre una vía para investigar preguntas locales, que no encuentran lugar en la agenda científica dominante.
El objetivo del taller es incentivar el uso de tecnologías abiertas de investigación en las aulas. En específico, esperamos i) facilitar el acceso a herramientas abiertas de investigación para su posterior implementación en aula, ii) capacitar a docentes para la enseñanza de técnicas de rutina usadas en laboratorios de investigación con el fin de fomentar el interés de los estudiantes por la ciencia y desarrollar su capacidad crítica y iii) impulsar el uso y desarrollo de la ciencia abierta en la sociedad mediante tecnologías libres.
¿En qué consistió el taller?
El taller consta de cuatro grandes actividades, una por día, que abordan cada una una problemática distinta. A continuación va el detalle de la semana:
Martes 17/01/2023: El RT-PCR es la técnica más ampliamente usada para la detección de ácidos nucleicos. Desde el inicio de la pandemia, hemos visto lo mucho que dependemos de este test para determinar con certeza si hemos sido infectados por el virus. Sin embargo, el alto costo de los equipamientos y reactivos que usa hace que test sea difícilmente accesible como sí lo pueden ser los tests rápidos de antígeno. Por eso, en este taller traemos un termociclador de bajo costo llamado PocketPCR y enzimas de producción local para realizar RT-PCR en la sala de clase.
Miércoles 18/01/2023: Técnicas para la detección de ADN. En esta instancia, revisaremos una técnica alternativa al RT-PCR para la detección de ácidos nucleicos llamada Loop-Mediated Isothermal Amplification (LAMP). LAMP es una reacción isotermal de alta especificidad y sensibilidad que permite la detección de patógenos y muestras de ácidos nucleicos en un amplio abanico de muestras. A diferencia del RT-PCR, no requiere de equipamiento costoso y puede ser operada con reactivos producidos localmente. Revisaremos su aplicación para la detección de ciertos genes en alimentos transgénicos mediante el kit GMO Detective y para la detección del patógeno Fusarium oxysporum que infecta plantaciones de tomates. También usaremos un equipo de bajo costo y libre acceso llamado qLAMP de la mano de un instructor internacional, Francisco Quero.
Jueves 19/01/2023: Enseñar los procesos de transcripción y traducción del ADN en la célula puede resultar muy teórico a la escala de la enseñanza básica y media. Para facilitar y mediar este proceso, traemos reacciones “cell-free”, que consisten en utilizar oportunamente la maquinaria transcripcional y traduccional de las células, sin que el sistema esté vivo. Es decir, traemos un sistema de síntesis de proteína in vitro totalmente seguro para su uso en sala de clase, junto con reporteros transcripcionales, traduccionales y sensores genéticos que nos permitirán visualizar a simple vista estos procesos que ocurren a escala microscópica.
Viernes 20/01/2023: Los microscopios son elementos muy importantes en el proceso de aprendizaje de los estudiantes en ciencias naturales. Permiten observar células vegetales, determinar sus componentes y organelos y ofrecen un soporte de muchísima ayuda a los docentes en la enseñanza de la biología. Por eso, queremos mostrar tres diseños alternativos de microscopios open source impresos en 3D (OFM, Salero y FluoPi), todos de bajo costo y compatibles con pantallas LCD o equivalente. Tener acceso a estos microscopios podría aumentar sustancialmente la disponibilidad de estos equipos en la sala de clase, junto con reducir los costos necesarios para conseguirlos, mejorando de esta forma la experiencia docente tanto para el/la profesor/a como para el/la estudiante.
Comienza la residencia de Tecnologias Abiertas reGOSH Mendoza 2022
¿Por qué tecnologías libres y abiertas para la ciencia?
En los últimos años, las tecnologías libres y en particular las herramientas científicas abiertas han ganado visibilidad entre investigadores y laboratorios de todo el mundo. Desde la fabricación de respiradores durante la pandemia hasta la construcción de equipos para analizar la densidad nutricional de alimentos, las tecnologías libres demuestran su potencial para dar respuesta a problemas complejos desde la apertura de la ciencia a nuevos actores y grupos sociales.
En nuestro contexto las tecnologías libres cobran todavía mayor relevancia. Frente a las históricas deficiencias de tecnología en las universidades y los reducidos presupuestos para ciencia, estas tecnologías constituyen una oportunidad concreta de acceso a infraestructura para la producción de conocimiento y abordaje de problemas relevantes. Contar con herramientas accesibles y modificables abre una vía para investigar preguntas locales, que no encuentran lugar en la agenda científica dominante.
SOBRE EL EVENTO
La Residencia, del 5 al 19 de septiembre, tiene como objetivo mejorar, alistar e integrar tecnologías libres existentes en relación a las necesidades de las comunidades usuarias en Mendoza. Hoy, estas comunidades buscan usar las herramientas para dar respuesta a preguntas y problemas relacionados con la transición agroecológica y la salud ambiental. Previo a la residencia se abrirá un llamado para quienes quieran participar: expertos en hardware, desarrolladores de software, comunicadores, científicos, investigadores, expertos en datos.
Una vez finalizada la residencia, el Encuentro, a desarrollarse entre el 20 y el 23 de septiembre, busca delinear una agenda común y estrategias que permitan la consolidación y el avance de esta red en Latinoamérica. Previo al encuentro también se abrirá el llamado para quienes quieran participar: usuarios, desarrolladores, investigadores, activistas y hacedores de políticas que trabajen o tengan interés en tecnologías libres (link entrevistas).
Así como los hongos trabajan en red a través del micelio, el Biofab de la UC se fue armando por una red de personas con intereses y visiones en común, una fascinación por el reino fungi, por conocer sus propiedades y sus posibilidades para crear biomateriales que aporten en la crisis ambiental y productiva que vivimos. Desde una mirada crítica al sistema productivo actual buscaron en la naturaleza alternativas para desarrollar un futuro más sustentable, desde sus diferentes profesiones el diseño, la arquitectura y las ciencias biológicas.
Lab de tecnología libre 