Recursos Educativos Abiertos para trabajos prácticos de biología molecular en casa, CAJALAB

Todos los recursos, links, repos, y protocolos estan descritos en https://osf.io/ezwhm/ (DOI 10.17605/OSF.IO/EZWHM)

Este sitio contiene todos los materiales necesarios para replicar practicos remotos (en casa) de 1) cinetica enzimatica, 2) amplificación de RNA via RT-PCR y 3) deteccción de GMO en alimentos via LAMP. Tambien se entrega información respecto a la cajalab utilizada para envio y realización de actividades en casa de estudiantes asi como los protocolos de sanitización (en pandemia).

Todos los archivos de diseños para el hardware, codigo python/jupyter notebooks, ADNs y protocolos de producción de enzimas y controles positivos son de libre acceso.

Protocolos de producciòn de enzimas para LAMP y RT-PCR:

BstLF Protocolo de producción y purificacióngenbank seq y el hilo de discusion en foro ReClone

MMLV RT Protocolo de producción y purificacióngenbank seq y el hilo de discusion en foro ReClone

Pfu-sso7D Protocolo de producción y purificacióngenbank seq y el hilo de discusion en foro ReClone

Todos los ADNs para la producción de estas enzimas son de libre acceso bajo openMTA

Codigos:

Codigo Openscad y STLs desarrollado en el curso para imprimir dispositivo de detecciòn de fluorescencia (repo Github)

Jupyter notebooks/Goolge colab para analizar fotos de GMOdetective (repo github)

Codigo para fabricacion de PCB (Autoria de G. Aidelberg, repo github)

Jupyter notebooks con codigo python para correr practicos de cinetica enzimatica en Google collab (repo github)

Dispositivos de hardware abierto:

pocket3tubos

Mini gel tank, no es de hardware abierto (el fabricante no libera archivos), pero no teniamos otra opcion por el poco tiempo. Estamos trabajando en version de libre acceso.

mini


GMOdetective (version original de acrilico, gracias Guy!)

GMOacr
GMOacr2
gmo

Version 3D: Alternativa de impresion 3D si no tienes acceso a cortadora laser pero si a una impresora 3D

3D0
3D

Cajalab

La caja fue elaborada por Sebastian Aguilera en colaboracion con el Lab de biofabricacion UC (Biofab), priorizando materiales de bajo costo y de buena sanitización (En el futuro, nos gustaría trabajar con cajas mas amigable socn el medio ambiente)https://www.youtube.com/embed/b5z3K8YAUCA

mini
caja2
cajaestud

casa2

Equipo de trabajo:

  • Isaac Nuñez
  • Valentina Zapata
  • Marta Blanco
  • M. Jose Avendaño
  • Sebastian Velozo
  • Tamara Matute
  • Alejandro Aravena
  • Fernan Federici

Colaboradorxs del proyecto:

  • Cesar Ramirez
  • Guy Aidelberg
  • Sebastian Rodriguez
  • Francisco Chateau
  • Sebastian Aguilera
  • Alex Brown
  • OpenBioeconomy Lab
  • GaudiLabs (Urs)
  • Paulina Merino
  • Valerie Decap
  • Ariel Cerda
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